免费JIZZ大全

最新2區SCI思路解析—楊樹TPS/TPP基因家族的系統分析

2區文章很難發嗎?對某些人是可望不可求;對另一些人則是信手拈來!這是命嗎?不是,是你選擇的研究思路問題,思想轉變一下,你也可以輕松發2區期刊!今天小編繼續用一篇最新見刊的文章給您啟發...

2區文章很難發嗎?對某些人是可望不可求;對另一些人則是信手拈來!這是命嗎?不是,是你選擇的研究思路問題,思想轉變一下,你也可以輕松發2區期刊!
今天小編繼續用一篇最新見刊的文章給您啟發,該文章于2021年7月21日發表于期刊:International Journal of Biological Macromolecules(IF=6.953,中科院分區:2區),下面我們一起看看這篇文章內容。

文章簡介

海藻糖在植物的代謝、生長發育和抗逆性等方面發揮著重要作用,而海藻糖-6-磷酸合成酶(TPS)和海藻糖-6-磷酸磷酸酶(TPP)在海藻糖合成過程中起著關鍵性作用,楊樹中仍未見關于TPS和TPP綜合分析的報道,故作者在基因組水平上對上述兩個基因家族進行了系統分析,為TPS和TPP深入研究及楊樹遺傳育種研究奠定基礎。

結果內容

1. 楊樹中PtTPS和PtTPP家族成員的鑒定
作者以擬南芥AtATPS和AtTPP序列為種子序列通過blast在楊樹中共鑒定到13個PtTPS和10個PtTPP,并通過DNAMAN軟件探究這兩個家族基因在楊樹和擬南芥2物種間的相似性。

attachments-2021-08-J1Ps0zqe610b41a47d07e.jpg

2. 楊樹中PtTPS和PtTPP家族成員的理化性質接下來作者分析了PtTPS和PtTPP家族成員的理化性質,包括CDS長度、等電點、平均親水性、亞細胞定位預測等,詳見上圖Table1/2。3.?楊樹中PtTPS和PtTPP家族成員蛋白保守結構域分析作者分析了PtTPS和PtTPP兩家族各自成員間Motif保守序列的差異。

attachments-2021-08-auWsQogY610b41d5df37b.jpg

4.?楊樹中PtTPS和PtTPP家族成員順式作用元件分析作者截取PtTPS和PtTPP家族成員轉錄起始點前2000bp序列進行順式作用元件分析。

attachments-2021-08-StEiZhdt610b4204dd228.pngattachments-2021-08-GeQ85Fgb610b4210a113a.jpg

5.?楊樹中PtTPS和PtTPP家族成員系統發育分析作者引入外源物種擬南芥、大豆、水稻、蘋果與楊樹的PtTPS和PtTPP家族成員一起繪制系統發育樹。

attachments-2021-08-rDoVeuLf610b422f0ec4b.png

6.?楊樹中PtTPS和PtTPP家族成員軟色體位置為了明確楊樹中PtTPS和PtTPP家族成員在基因組分布特點,作者繪制了兩家族基因染色體位置圖。

attachments-2021-08-O3lK1Xy8610b424c19ded.png

7.?楊樹中PtTPS和PtTPP家族成員蛋白結構特征作者進一步分析PtTPS和PtTPP家族成員二級結構特征及3D三維結構。

attachments-2021-08-XnOBq8kk610b4286b7ced.jpg

8.?楊樹中PtTPS和PtTPP家族在不同組織及不同環境下的表達情況作者從NCBI-GEO數據庫下載的楊樹不同組織及不同環境下的基因表達數據,分析了PtTPS和PtTPP家族成員在不同組織(葉、莖尖、根)及不同處理下(水楊酸、茉莉酸甲酯處理,干旱處理)的表達情況,繪制的表達熱圖如下:

attachments-2021-08-oT9BsKww610b429c13ce4.jpgattachments-2021-08-NT6g9Yjo610b42a547928.jpg

9.?雄性和雌性花蕾的基因表達作者又通過RT-QPCR測定了楊樹不同發育階段雄性花芽和雌性花芽中PtTPS和PtTPP家族成員表達模式的變化。

attachments-2021-08-jyi8UGhl610b42bfb07a7.jpgattachments-2021-08-pnqOtlzk610b42c9b2881.jpg

總結

以上就是該篇文章全部分析內容,回頭看一下其實也很簡單,并沒有什么高深的分析或者實驗,大部分是生信分析內容,2區期刊文章也不過如此!(組學大講堂公眾號下提交關鍵詞“楊樹下載原文獻我們《基因家族實操分析》培訓班所教的分析內容遠多于該文章展示的內容,培訓內容如下:1、檢索基因家族成員蛋白保守結構域,鑒定基因家族成員;2、基因結構分析及繪圖;3、基因在染色體上的位置分析及繪圖;4、啟動子區域序列提取及預測順勢作用元件;5、構建系統進化發育樹;6、基因家族成員Motif分析及繪圖;7、MCScanX共線性分析,繪制基因組內基因家族成員共線性circos圖;8、計算串聯重復基因的KA/KS;9、和其他物種間的基因組共線性分析及繪圖;10、結合轉錄組數據繪制家族基因的表達量熱圖;11、家族基因亞細胞定位分析;12、家族基因蛋白序列多序列比分析及繪圖;13、家族基因蛋白質3D結構分析;14、家族基因蛋白質互作網絡分析;以上這14項分析內容絕對滿足2區及以上文章的撰寫,學會以上分析,2區文章還用愁嗎?假如您對基因家族分析感興趣,就來參加我們第17期《基因家族實操分析》培訓班吧!3天時間學會分析技能,實現SCI自由!

培訓報名

組學大講堂是專業的生物信息培訓機構,培訓學員已超過35000人,僅基因家族分析實操班就已舉辦過16期,是國內該課程培訓經驗最豐富、最專業的機構。本課程有如下優勢:
① 課程針對
0基礎學員設計,邊學邊練,現場指導;
② 不使用純Linux系統或者連接遠程云服務器的方式,而是采用先進的docker虛擬機去教學(國內首創),docker具有強大的可移植性,你可以在任何一臺Windows電腦、蘋果電腦、服務器上輕松的進行課上所學操作,而不用擔心安裝生信軟件、配置分析環境等繁瑣、復雜的難題。真正的能學會,能用起來;
③ 我們建立了專門的生物信息知識問答社區,已經累計解決了上千個生信學習相關問題,結合學員QQ群持續為您學習提供技術支持!

培訓課程表

本期培訓將于2021年8月20日-8月22日,在騰訊會議直播舉辦。培訓班課程表如下:

attachments-2021-08-kR8IS7q4610b42f51467c.png

培訓費用

原價2998元/人券后價2498元/人可開發票;其他問題可加微信:18510686772(電話同號)咨詢。優惠券領取:轉發本文到您的朋友圈并集贊15個,然后將截圖發給微信“18510686772”,我們將為您折現優惠500元。

優惠信息

1. 贈送價值499元《基因家族分析》視頻課程及價值199元《Linux系統的使用》視頻課程;已購買過該課程的報名人員,則按實際購買價折現予以優惠。

時間及地點

2021年8月20日-8月22日(周五至周日);騰訊會議直播想參加的老師,趕緊掃描下面的二維碼進行報名吧!

attachments-2021-08-2czwsvoh610b431600119.jpg

1. 文章越來越難發?是你沒發現新思路,基因家族分析發2-4分文章簡單快速,又能發文章,又能學生信技能,一舉兩得的SCI好思路;基因家族分析課程已更新分析內容,最新版課程學習鏈接

2. 轉錄組數據結果理解不深入?圖表看不懂?這就是你轉錄組數據不會挖掘、文章不會撰寫的原因,讓我帶你一起深入了解轉錄組數據結果,學習鏈接:;

3. 轉錄組數據深入挖掘技能-WGCNA,提升你的文章檔次,學習鏈接:

4. 轉錄組數據怎么挖掘?多學點數據處理技能:學習鏈接:

5.微生物多樣性分析很簡單,但是分析內容項目并不少,理解起來有困難?看我深入淺出講給你聽,學習鏈接:?

6. 學生物的必學生信技能:、、

7. 生信繪圖、科研繪圖技能:、、、

8.生物信息實戰技能,0基礎也可以學會,內含腳本及demo數據:、、微生物多樣性自主分析

9. 更多學習內容:linux、perl、R語言畫圖,更多免費課程請掃描下方二維碼進入組學大講堂網校學習:

attachments-2018-11-eEmO1t6q5c01489ecbc34.jpg


你可能感興趣的文章

相關問題

0 條評論

請先 登錄 后評論
紅橙子
紅橙子

78 篇文章

作家榜 ?

  1. omicsgene 559 文章
  2. 安生水 256 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女學霸 120 文章
  5. 紅橙子 78 文章
  6. CORNERSTONE 72 文章
  7. 生信老頑童 50 文章
  8. landy 37 文章