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手把手教你在線分析轉錄因子結合調控分析(植物)

手把手教你轉錄因子結合調控分析

今天介紹一個植物的轉錄因子調控的綜合性分析網站PlantRegMap,該網站的功能非常的強大,其主要功能包括如下:

1. 植物轉錄因子預測????

輸入蛋白序列或者核酸序列即可對是否是轉錄因子進行預測,如果是轉錄因子,會對轉錄因子的結合位點,保守性等有詳細的信息。

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2. 轉錄因子結合位點預測

選擇一種物種,輸入轉錄因子上游的Promoter 序列,即可預測哪些轉錄因子結合于Promoter 哪個區域? ? 。

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3.??轉錄因子富集分析?

輸入一組基因的名稱,即可預測調控這些基因的轉錄因子,并對轉錄因子進行功能富集分析,富集顯著的轉錄因子即為最重要的調控因子。

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4. 調控網絡分析? ?

綜合前面的兩種分析模式,即可進行調控網絡的分析。選擇一個物種,輸入一組基因的promoter序列,就可以對調控這些基因的轉錄因子進行分析,并可以對轉錄因子進行富集分析,這就可以篩選出關鍵作用的轉錄因子。結果如下:

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5. GO 富集分析? ?

針對一組基因進行GO富集分析,分別從分子功能,細胞組份和生物過程3個方面進行功能富集分析。

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學會利用好這個網站,分析轉錄因子的調控,那就易如反掌了。 文章越來越難發?是你沒發現新思路,基因家族分析發2-4分文章簡單快速,學習鏈接:。

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  • 發表于 2018-08-16 22:50
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紅橙子
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